最长公共子串

最长公共子序列和最长公共子串区别

最长公共子串（Longest Common Substring）与最长公共子序列（Longest Common Subsequence）的区别：

子串要求在原字符串中是连续的，而子序列则只需保持相对顺序一致，并不要求连续。

例如  X = {a, Q, 1, 1}; Y = {a, 1, 1, d, f}

那么，{1, 1}是X和Y的最长公共字串。

思路

我们的目的是寻找两个顺序绝对一致的序列

所以我们需要构建一个二维数组进行统计，记录遍历的时候他们相同的地方

设有这样的两个序列:

{A,A,C,G,T,T,A,G}

{A,C,G,T,A}

 第一行的意思可以看作空和空.空和A。。。的最长子序列都为0

从第二行开始，如果相同就将左上角的值复制加一填入，所以这里就填上   1（0+1）

 到C的时候，A和C是不一样的，直接填入0

 到下一个A又相同，就把左上角的值加一填入

 之后不一样的都填入0

到第二行时，C与C一样了，填入左上角的元素值加一，也就是1+1= 2，填入2

填完后得到

 很明显表中的最大值就是他的最长子串

状态转移方程代码

 通过以上的分解后，我们可以得到这样一个状态转移方程

if(a===b){
table[row][col] = table[row - 1][col - 1] + 1;//如果一样，我们找到他斜上角的那个值进行加一之后赋值
} else { 
table[row][col] = 0; //如果不相同，我们就填入0
}

原文地址：http://www.cnblogs.com/kuailest/p/16879235.html