https://zhuanlan.zhihu.com/p/460339798

 

01. 单细胞蛋白质组学揭示细胞周期时空蛋白图谱 (Spatiotemporal dissection of the cell cycle with single-cell proteogenomics.)

用免疫荧光强度定义蛋白表达量

 02. CoTECH新技术实现单细胞多维表观重构 (Single-cell joint detection of chromatin occupancy and transcriptome enables higher-dimensional epigenomic reconstructions.)

笑死,根本没有蛋白组

03. 利用离子电流提取再定量法(IceR)提高单细胞蛋白质组检测性能(IceR improves proteome coverage and data completeness in global and single-cell proteomics)

一种提高质谱鉴定能力的方法,与MQ相比大约提高30-40%(不很确定,没有复现过,而且文中用了很多指标比较性能)

文中用单细胞大肠杆菌和血浆蛋白进行分析测试,其中单细胞大肠杆菌可以鉴定到200-400个蛋白,需要了解真核可以鉴定到多少蛋白

04. 功能性翻译组蛋白质组学揭示 mTORC1和 eIF2α 的收敛性和剂量依赖性调控(Functional Translatome Proteomics Reveal Converging and Dose-Dependent Regulation by mTORC1 and eIF2α.)

文章中原本的第四篇文章有一个重点概念boosting channel很难查到,于是先看这一篇是发明boosting channel的。

 boosting channel:

可以提高同位素标记很少情况下检测出的肽段数量。

04. 单细胞蛋白质组学揭示白血病干细胞异质性 (Quantitative single-cell proteomics as a tool to characterize cellular hierarchies.)

文章没什么很大的创新,提供了一个基于scanpy的单细胞蛋白组学的python包和流程,的结果和图都中规中矩,是nc的水平。

原文地址:http://www.cnblogs.com/agis/p/16900527.html

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